Het park is verdeeld in twee sectoren. De noordelijke sector, Mweya, strekt zich uit over de evenaar, de bezaaide vallei omlijst door de Rwenzoris en de Kichwamba-helling in het noorden en zuiden, met de meren George en Edward in het oosten en westen. De verscheidenheid aan habitats in QENP biedt een schat aan activiteiten, zoals de populaire door vogels omzoomde lanceringscruise van Kazinga Channel (het park heeft meer dan 600 vogelsoorten, meer dan enig ander park in Oost-Afrika, het intrigerende explosiemeer met panoramische uitzichten, begeleide wandelingen in de Kyambura Gorge om de kans te krijgen om de chimpansees te spotten, en de Oegandese Kob-broedplaatsen van de Kasenyi-vlaktes die leeuwen, hyena's en luipaarden aantrekken, bieden meer traditionele mogelijkheden om wilde dieren te zien. In het zuiden is de Ishasha-sector een wildere, meer afgelegen bestemming.

 Ver van de drukte zijn er geen gimmicks, gewoon ouderwetse wildernis. De glooiende vlaktes zijn de thuisbasis van kuddes olifanten, kob, lokale leeuwentrots die bekend staan als boomklimmende leeuwen.