Le parc est divisé en deux secteurs. Le secteur nord, Mweya chevauche l'équateur, la vallée cloutée encadrée par les Rwenzoris et l'escarpement de Kichwamba au nord et au sud, avec les lacs George et Edward à l'est et à l'ouest. La variété d'habitats dans QENP offre une multitude d'activités comme la populaire croisière de lancement bordée d'oiseaux du canal Kazinga (le parc compte plus de 600 espèces d'oiseaux, plus que tout autre parc d'Afrique de l'Est, le lac d'explosion intrigant qui offre des vues panoramiques, des visites guidées des randonnées dans les gorges de Kyambura pour avoir une chance d'apercevoir les chimpanzés et les aires de reproduction de l'Ouganda Kob des plaines de Kasenyi qui attirent les lions, les hyènes et les léopards offrent une observation plus traditionnelle de la faune.Au sud, le secteur d'Ishasha est une destination plus sauvage et plus éloignée.

 Loin de la foule, il n'y a pas de gadgets, juste une nature sauvage à l'ancienne. Les plaines vallonnées abritent des troupeaux d'éléphants, de kob, des fiertés locales de lions connues sous le nom de lions grimpants dans les arbres.